Датасет · ctheodoris
30 млн транскриптомов человека для Geneformer
ctheodoris/Genecorpus-30M
Корпус из ~30 млн одиночных клеточных транскриптомов человека для предобучения Geneformer.
Что внутри
Genecorpus-30M — крупный корпус для предобучения, собранный из примерно 30 миллионов одиночных клеточных транскриптомов человека. Данные охватывают широкий спектр тканей и взяты из публично доступных источников. На этом корпусе предобучали трансформер Geneformer для контекстных предсказаний при ограниченных данных.
Что можно сделать
- Предобучение Geneformer или похожего трансформера
- Fine-tune модели для клеточных предсказаний
- Проверка контекстных эмбеддингов транскриптомов
- Скачиваний за месяц
- 1 тыс.
- Лайков
- 88
Модели, обученные на нём
- ctheodoris/GeneformerЗаполнение пропусков 1,7 тыс.
- nvidia/geneformer_V2_316MЗаполнение пропусков 289
- nvidia/geneformer_V1_10MЗаполнение пропусков 265
- nvidia/geneformer_V2_104MЗаполнение пропусков 262
- nvidia/geneformer_V2_104M_CLcancerЗаполнение пропусков 243
- Iambackup/geneformer_V2_316MЗаполнение пропусков 78
- pengxunduo/Geneformer-RNAquarium 14
- Anler777/Geneformer 10
Как загрузить
from datasets import load_dataset
ds = load_dataset("ctheodoris/Genecorpus-30M")